咖啡原產於非洲，有許多變種。每一變種都同特定的氣候條件和一定的海拔高度有關。野生咖啡樹是常綠灌木，高3米至3.5米，分支上有白色小花，具有茉莉花的香味。果實長1.5至1.8厘米，紅色，內有相鄰排列的兩粒種子，每粒種子外均包有內果皮和表膜。
全世界的咖啡屬植物大約有60多種，人工栽培用於製作咖啡的只有25種，其中用作商品咖啡的只有4種：大果咖啡（Coffea liberica）、中果咖啡（Coffea canephora）、小果咖啡（Coffea arabica）和高產咖啡（Coffea dewevrei）。
臺灣所生非人工栽培的物種有C. arabica、C. liberica、剛果咖啡（C. robusta。）
小果咖啡：被公認為最優良品種，只能生長在海拔600米以上、土地肥沃、排水良好的丘陵地帶，因此最初僅種植於喀麥隆和幾內亞高原，後引入拉丁美洲和亞洲。
中果咖啡：原產地在中非。變種之一為粗壯咖啡（Coffea robusta），其耐病能力和產果率更高，能栽培於小果咖啡無法生存的濕熱地區，主要用來生產速溶咖啡。
大果咖啡：原產地是賴比瑞亞，分布很廣，耐性很強，但質量較差。